在加冕的问题上，以西斯内罗斯枢机为首的西班牙廷臣与以马克西米连一世的使臣为首的神圣罗马帝国廷臣争执不休，因为神圣罗马帝国的廷臣们坚持要让教皇来为小查理加冕，而且要在罗马，毕竟神圣罗马帝国的皇帝几乎都是前去罗马接受教皇加冕的，腓特烈三世去世之后，马克西米连一世宣称自己为神圣罗马帝国的皇帝，因为威斯尼人堵塞了奥地利前往罗马的大道，因为未能成行，还是当时的教皇英诺森八世，在索要了一大笔钱财后，委托特兰托大主教代为转交了授权批准的文书。
对此，马克西米连一世一直深以为憾，他总是希望他的子孙能够在罗马接受教皇的加冕的，而且，鉴于这位皇帝与尤利乌斯二世达成的交易，想让这位年轻的教皇为小查理加冕也不会是是件难事。而且，对于西班牙的廷臣们所希望的，小查理在托莱多大教堂，由托莱多大主教，也就是西斯内罗斯枢机代为加冕的事儿，他们是坚决反对的。
西班牙的廷臣们当然能够猜到这些神圣罗马帝国人的想法，毕竟他们也怀抱着相同的心思——如果小查理是在托莱多加冕的，那么在这位年幼君主最初的意识里，他是个西班牙国王，而不是神圣罗马帝国的皇帝，但此时马克西米连一世还不准备那么快的去见仁慈的天主，也只好先让他去罗马，在罗马加冕为西班牙国王，以消弭西班牙人对他可能的影响。
但就在三天后，西斯内罗斯枢机就在托莱多大教堂，志满意得地举起了国王的冠冕，轻轻地放在王储查理的头上——王储查理就此成为了西班牙国王，查理五世，而且他之后还会继承更多的领地，但他现在的神色并不如人们期望的那样好——他正处于一个相当尴尬的年纪，不是个孩子了，但也不是一个成人，而在这个年龄阶段的男孩，几乎都有着强烈的虚荣心与自尊心——他是见过自己的母亲，胡安娜一世的加冕仪式的，因为这是卡蒂斯利亚与阿拉贡两国合二为一的首位君主的加冕仪式，所以格外的盛大与辉煌。
而查理五世的加冕仪式却要匆忙与简陋了许多，倒不是西班牙人与神圣罗马帝国的人有意怠慢，而是现在的情况不允许他们将珍贵的时间，人力与钱财耗费在一场仪式上——贡萨洛德科尔多瓦，特拉诺瓦公爵，他不但从神圣罗马帝国与西斯内罗斯枢机的手中逃脱了，还带走了被藏在塞戈维亚城堡的女王次子斐迪南。在卡蒂斯利亚议会的支持下，他悍然以女王胡安娜一世的名义发动了叛乱，当然，对于他们来说，这是一场正义之战，而且卡蒂斯利亚人以及一部分阿拉贡人都是这样认为的，有许多领主或是倒向贡萨洛与斐迪南王子，或是索性袖手旁观。
另外，他们也得到了消息说，罗马先是发生了平民暴动，然后法国人借机侵入罗马，占领了梵蒂冈宫与圣天使堡，教皇尤利乌斯二世与他的教士们逃走了，不知所踪，这样，就算查理去了罗马，也没人给他加冕，反而会成为法国人的人质。
年仅九岁的查理五世并未被允许了解其中的详情，他或许以后会成为一个睿智而又强悍的统治者，但对于现在的他来说，还没有那个资格与智慧让那些奸猾的臣子与领主们服从于他，他被安排了很多课程，教师之中，神圣罗马帝国的人占了大半，他身边的护卫也是，他发现，虽然他成为了国王，却不比以往自由、愉快——这些人似乎在努力地争取他倾向于其中一边，西班牙，还是神圣罗马帝国？查理认为，自己无需选择，因为他终究会成为这两个国家的主宰，但他的教士与护卫却认为这种想法是绝不可取的，他们一再地指引、劝诱甚至威胁，反而让查理生出了无比强烈的逆反心理。
或者说，他是见过他的母亲，胡安娜一世是如何做王的，虽然人们都说，她是个疯癫的女人，但她安坐在宝座上的时候，即便是西斯内罗斯枢机，或是特拉诺瓦公爵也不敢如同现在的教士与护卫对他一般轻